הארכיון ההיסטורי של ראשון לציון הוקם בשנת 1972 והפך לחלק ממוזיאון ראשון לציון עם הקמת המוזיאון בשנת 1982.
בארכיון 28 חטיבות של חומר מנהלי (פרוטוקולים של ועד המושבה, חומרים ממחלקות העירייה השונות, מרשמי אוכלוסין) וכ-230 חטיבות של חומר תיעודי הכולל אוספים ארגוניים של מוסדות ומפעלים (כגון ארכיון היקב, ארכיון בית הספר העברי הראשון, ארכיון עדת התימנים בראשון לציון ועוד). בנוסף, החומר התיעודי כולל כ-160 אוספים אישיים של משפחות המייסדים, אישי ציבור ותושבי ראשון לציון.